工商管理系创立于1995年，前身是企业管理教研室。1985年设立经济管理专业，1989年更名为企业管理专业，成立企业管理教研室。1995年更名为工商管理专业，成立工商管理系。1999年实施大类招生教学，2000年获企业管理硕士学位授予权，同年获工商管理硕士（MBA）专业学位授予权，2009年获高级管理人员工商管理硕士（EMBA）专业学位授予权，2011年获工商管理一级学科硕士学位授予权，2019年入选内蒙古自治区首批一流专业建设点。

植根北疆，面向全国，服务向北开放，旨在培养熟悉国情区情，有高度社会责任感、双创精神与国际视野，掌握现代经济管理理论与方法，具备分析解决工商管理问题能力，胜任企事业单位或行政部门管理工作的复合型卓越人才，成为北部边疆新商科教育的引领示范基地。

工商管理系现有专职教师24名，其中教授6人，副教授8人，讲师10人。硕士生导师20人，博士生导师3人。具有博士学位19人，是一只学术梯队合理、教研经验丰富的师资队伍。工商管理系教师共承担了多项国家级科研基金课题；多篇学术成果发表在国内顶尖学术期刊，包括《管理世界》、《中国工业经济》、《研究与发展管理》、《管理学报》等；出版学术著作10余部。为多家地方政府部门和本土企业的发展战略规划、商业模式设计、薪酬体系设计、市场营销策划等提供咨询服务。经过近20年的发展，工商管理系所培养的本科生和研究生，备受工商企业、政府机关和科研院校等社会各界的欢迎，甚至有部分毕业生已经成为所在单位的业务骨干乃至走上领导岗位，为学校和学院赢得了良好的社会声誉。